blosum62_liu_Luc.dat 1.22 KB
Newer Older
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27
# Original Matrix from Liu and al 2006
#
# lm 2013/01/07 added B,J,Z amino acids by meaning
# D/N, E/Q, L/I respectively
A 10 3 4 3 5 3 5 2 5 5 4 5 4 3 4 4 4 7 4 6 2 3 4
B 3 10 3 8 6 3 4 4 3 2 4 2 2 8 3 5 4 6 3 2 2 2 5
C 4 3 10 3 2 3 3 2 5 5 2 5 4 3 2 2 3 4 3 4 3 3 2
D 3 8 3 10 7 3 4 3 3 2 4 2 2 6 4 5 3 6 3 2 2 2 6
E 5 6 2 7 10 3 3 4 3 3 6 3 3 5 4 7 5 6 3 3 2 3 8
F 3 3 3 3 3 10 3 4 5 5 3 5 5 3 2 3 3 3 2 4 4 7 3
G 5 4 3 4 3 3 10 2 2 2 3 2 2 5 3 3 3 6 2 2 3 2 3
H 2 4 2 3 4 4 2 10 3 3 4 3 3 5 3 4 4 4 2 2 3 6 4
I 5 3 5 3 3 5 2 3 10 9 2 8 6 3 2 3 3 3 3 9 2 3 3
J 5 2 5 2 3 5 2 3 9 10 2 9 6 3 2 3 3 3 3 8 2 3 3
K 4 4 2 4 6 3 3 4 2 2 10 3 4 5 4 6 7 6 3 3 2 3 6
L 5 2 5 2 3 5 2 3 8 9 3 10 7 3 2 4 4 3 3 7 3 3 3
M 4 2 4 2 3 5 2 3 6 6 4 7 10 3 3 5 4 4 3 7 3 3 4
N 3 8 3 6 5 3 5 5 3 3 5 3 3 10 3 5 5 7 4 2 2 3 5
P 4 3 2 4 4 2 3 3 2 2 4 2 3 3 10 4 3 4 3 3 2 2 4
Q 4 5 2 5 7 3 3 4 3 3 6 4 5 5 4 10 6 6 3 3 3 3 8
R 4 4 3 3 5 3 3 4 3 3 7 4 4 5 3 6 10 4 3 2 2 3 5
S 7 6 4 6 6 3 6 4 3 3 6 3 4 7 4 6 4 10 6 3 2 3 6
T 4 3 3 3 3 2 2 2 3 3 3 3 3 4 3 3 3 6 10 6 3 3 3
V 6 2 4 2 3 4 2 2 9 8 3 7 7 2 3 3 2 3 6 10 2 4 3
W 2 2 3 2 2 4 3 3 2 2 2 3 3 2 2 3 2 2 3 2 10 6 2
Y 3 2 3 2 3 7 2 6 3 3 3 3 3 3 2 3 3 3 3 4 6 10 3
Z 4 5 2 6 8 3 3 4 3 3 6 3 4 5 4 8 5 6 3 3 2 3 10